Bioinformaticien – H/F

Ecoutez le texte avec ReadSpeaker
date de publication 20/12/2019 par Isabelle Degrave-Nicolas

Contrat : CDI

Description :

 

Référence offre :
2019-12-422/1-73

 

Pour télécharger l'annonce, cliquer ci-dessous :

 

Contexte

L'Institut Claudius Regaud IUCT-ONCOPOLE, Centre de Lutte Contre le Cancer, recherche un responsable pour la cellule bioinformatique de l'IUCT-Oncopole. CDI Temps plein à pourvoir selon la disponibilité du/de la candidat(e).

La cellule de bioinformatique a pour objectif de proposer une expertise et des outils afin d'accompagner les équipes médicales principalement dans le diagnostic des patients et pour leurs projets de recherche. L'équipe de 8 bioinformaticiens travaille principalement sur la comparaison, l'analyse, la diffusion et la sauvegarde des données issues de séquençage haut débit (NGS). Le poste est rattaché à la Direction du Système d'Information et au laboratoire.

Missions

Le responsable Bioinformatique :
- assurera la gestion des moyens humains et matériels de la cellule de bio-informatique ;
- définira les choix technologiques, la mise au point et la validation scientifique des solutions d'analyse des données de séquençage à visée diagnostique ;
- organisera et participera à la formation et au support des utilisateurs dans l'application et la compréhension des méthodes d'analyses ;
- veillera au respect des normes qualité régissant le fonctionnement des laboratoires ;
- réalisera la veille scientifique ;
- participera à la conception et au suivi des projets de développement des logiciels conduits par la plateforme ;
- participera au montage, au suivi et à la valorisation des projets de recherche portés par l'IUCT concernant le NGS et la bioinformatique ;
- assurera une activité ponctuelle d'enseignement dans des modules universitaires et dans l'encadrement d'étudiants.

Profil recherché :

Niveau bac+5 en bio-informatique (Master bioinformatique, Master analyse et modélisation des données, Master Sciences du vivant spécialité bioinformatique, Master Biotechnologie et informatique, école d'ingénieur en biotechnologie spécialité bioinformatique).

Expérience de management d'équipe d'au moins 2 ans.
De préférence, expérience au sein d'une structure utilisant le NGS à visée sanitaire dans des laboratoires accrédités ou en cours d'accréditation.

Savoir-faire requis
• Management d’équipe.
• Conduite de projet informatique : posséder de bonnes pratiques de méthodes de développement informatique (méthodes agiles, modélisation, gestion de version via Git, tests unitaires, fonctionnels et applicatifs…).
• Programmation : maîtriser les langages de programmation : Java, Python.
• Bioinformatique : maîtrise des logiciels et pipelines d’analyse de données de NGS (recherche de SNV, CNV).
• Rechercher, sélectionner, exploiter et capitaliser les informations liées à la veille dans son domaine d'activité.

Serait un plus
• Programmation dans différents environnements informatiques en particulier sur une structure de type HPC.
• Connaissance des environnements virtuels (VM et Singularity).
• Connaissance de Snakemake.

Aptitudes
• Excellentes qualités relationnelles, d'écoute et de communication.
• Capacité à manager une équipe.
• Grande autonomie et capacité organisationnelle.
• Travail en équipe avec des facilités à transmettre ses connaissances à d’autres métiers.

 

Rémunération :

Selon la convention des CLCC

Horaires :

Temps plein